Чудотворный образ святителя и чудотворца Николая.
Главный престол нижнего храма освящен во имя святителя Николая Чудотворца Мир Ликийских. К нему, как небесному покровителю моряков и путешествующих, возносили свои молитвы офицеры и матросы Гвардейского флотского экипажа, как к заступнику и угоднику Божию молились простые прихожане. К нему и ныне обращаем мы свои молитвы и надежды, поклоняясь почитаемой его иконе с частицей святых мощей.
Главная святыня храма —образ святителя Николая Чудотворца, греческого письма XVII века. Он хранился еще в первоначальной деревянной церкви. Икона была подарена греческими моряками. Позже были написаны клейма вокруг иконы в стиле интерьера собора. Образ помещен в обрамление с клеймами — сценами из жития святителя. Обрамление более позднего времени, чем сама икона. Икона находится в нижнем храме святителя Николая, на западной стороне столба у левого клироса. Перед ней устроено небольшое возвышение со ступеньками.
В настоящее время в одном киоте с почитаемой иконой хранится частица мощей святителя Николая Чудотворца в небольшом медальоне в серебряном окладе, которая была подарена митрополитом Гор Ливанских Илией. Он посетил Никольский собор в ноябре 1947 года. Митрополит Илия всю войну просил Господа укрепить народ России, который нес очень тяжелые потери и страдания. И когда ему представилась возможность приехать в непокоренный город, то он привез частицу святых мощей для их духовного укрепления.
Ранее в соборе также хранилась частица мощей святителя, но, вероятно, она оказалась утрачена во время изъятий ценностей в 1920-е - 1930-е годы. Старинная святыня была даром императрицы Александры Федоровны, супруги императора Николая I.